Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CREB3O43889 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CREB3O43889 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms