Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRRT4C9JH25 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PRRT4C9JH25 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms