Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SRRM3A6NNA2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SRRM3A6NNA2 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms