Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TMED7Q9Y3B3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TMED7Q9Y3B3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms