Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
L1RE1Q9UN81 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms