Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH22Q9UJ99 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms