Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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