Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MBD5Q9P267 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MBD5Q9P267 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms