Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20BQ9P0W2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms