Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TK2-206ENST00000527800 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
C2orf88Q9BSF0 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms