Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms