Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGIP1Q9BQI5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGIP1Q9BQI5 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms