Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RPS6KC1Q96S38 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms