Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP13Q92995 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
USP13Q92995 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
USP13Q92995 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms