Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TMIEQ8NEW7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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