Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LNX2Q8N448 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LNX2Q8N448 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms