Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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