Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC84Q86UT8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms