Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APTXQ7Z2E3 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms