Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMPD1Q5SYB0 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms