Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TDRD12Q587J7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TDRD12Q587J7 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms