Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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SP6Q3SY56 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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