Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZIC3-201ENST00000287538 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CTCFL-217ENST00000608425 2915 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ITIH5-209ENST00000613909 2916 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GCM1-201ENST00000259803 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DPY19L2P3-201ENST00000414296 2326 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC012676.5-201ENST00000624337 1955 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms