Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LETM2Q2VYF4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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