Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM187BQ17R55 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms