Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATP6V1FQ16864 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms