Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FSCN1Q16658 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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