Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SLC18A3Q16572 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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