Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SKIV2LQ15477 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SKIV2LQ15477 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms