Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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RFTN1Q14699 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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