Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH18Q13634 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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