Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CUL4BQ13620 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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