Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TOP3AQ13472 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TOP3AQ13472 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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