Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms