Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
IKZF1Q13422 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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IKZF1Q13422 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IKZF1Q13422 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IKZF1Q13422 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
IKZF1Q13422 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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IKZF1Q13422 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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