Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AP3B2Q13367 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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