Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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