Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
NPRL3Q12980 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms