Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RAB40BQ12829 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms