Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms