Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPAL4Q0D2K0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms