Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSRP1Q08945 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms