Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NLRP2-206ENST00000427260 3411 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CD300CQ08708 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms