Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms