Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TYRO3Q06418 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms