Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
DEUP1Q05D60 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DEUP1Q05D60 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms