Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CTDSPL2Q05D32 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms