Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GBE1Q04446 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GBE1Q04446 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms