Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
OC90Q02509 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
OC90Q02509 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
OC90Q02509 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms