Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDR2Q01850 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 497.8 ms